Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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