Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp12Q9D9M2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp12Q9D9M2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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