Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms