Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Capns2Q9D7J7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Capns2Q9D7J7 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Capns2Q9D7J7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Capns2Q9D7J7 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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