Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms