Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Krt20Q9D312 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Krt20Q9D312 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Krt20Q9D312 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Krt20Q9D312 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Krt20Q9D312 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Krt20Q9D312 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Krt20Q9D312 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Krt20Q9D312 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krt20Q9D312 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms