Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snapc3Q9D2C9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms