Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syf2Q9D198 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms