Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hddc3Q9D114 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms