Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rfc5Q9D0F6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rfc5Q9D0F6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms