Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Mms19Q9D071 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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