Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtpbp8Q9CY28 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gtpbp8Q9CY28 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtpbp8Q9CY28 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtpbp8Q9CY28 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms