Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Xrcc3Q9CXE6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms