Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cxxc1Q9CWW7 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cxxc1Q9CWW7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cxxc1Q9CWW7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Cxxc1Q9CWW7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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