Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkrip1Q9CWV6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms