Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms