Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ddx28Q9CWT6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddx28Q9CWT6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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