Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms