Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rprd1bQ9CSU0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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