Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rnaseh2cQ9CQ18 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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