Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms