Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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