Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrbp1Q99PL5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrbp1Q99PL5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrbp1Q99PL5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms