Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms