Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hdac9Q99N13 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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