Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms