Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprtQ99M80 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprtQ99M80 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprtQ99M80 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprtQ99M80 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprtQ99M80 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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