Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms