Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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