Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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