Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp16Q99LG0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms