Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ciao1Q99KN2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ciao1Q99KN2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ciao1Q99KN2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ciao1Q99KN2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ciao1Q99KN2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ciao1Q99KN2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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