Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pacsin3Q99JB8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms