Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ctu1Q99J10 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ctu1Q99J10 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ctu1Q99J10 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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