Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn16Q925N4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Cldn16Q925N4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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