Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms