Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms