Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Smg8Q8VE18 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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