Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh10Q8VCH7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms