Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OptnQ8K3K8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms