Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc12Q8K2L8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms