Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Abcf3Q8K268 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Abcf3Q8K268 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Abcf3Q8K268 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Abcf3Q8K268 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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