Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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