Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms