Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trip10Q8CJ53 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Trip10Q8CJ53 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms