Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Mterf1aQ8CHZ9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Mterf1aQ8CHZ9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Mterf1aQ8CHZ9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mterf1aQ8CHZ9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms