Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab11fip3Q8CHD8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms