Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms