Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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