Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Pramef8Q8CE24 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms